Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTHFRP42898 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms