Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR7P32248 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR7P32248 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR7P32248 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR7P32248 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR7P32248 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR7P32248 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR7P32248 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR7P32248 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR7P32248 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR7P32248 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR7P32248 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR7P32248 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR7P32248 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR7P32248 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR7P32248 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR7P32248 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR7P32248 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR7P32248 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR7P32248 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR7P32248 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR7P32248 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR7P32248 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR7P32248 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR7P32248 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR7P32248 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR7P32248 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR7P32248 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR7P32248 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR7P32248 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR7P32248 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR7P32248 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR7P32248 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR7P32248 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR7P32248 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR7P32248 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCR7P32248 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCR7P32248 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR7P32248 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR7P32248 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR7P32248 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR7P32248 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR7P32248 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR7P32248 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR7P32248 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR7P32248 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR7P32248 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR7P32248 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR7P32248 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR7P32248 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR7P32248 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR7P32248 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR7P32248 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCR7P32248 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR7P32248 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR7P32248 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR7P32248 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR7P32248 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR7P32248 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR7P32248 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR7P32248 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR7P32248 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR7P32248 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR7P32248 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR7P32248 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR7P32248 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR7P32248 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR7P32248 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR7P32248 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR7P32248 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR7P32248 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR7P32248 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR7P32248 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR7P32248 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR7P32248 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR7P32248 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR7P32248 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR7P32248 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR7P32248 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR7P32248 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR7P32248 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR7P32248 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR7P32248 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR7P32248 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR7P32248 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR7P32248 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR7P32248 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR7P32248 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR7P32248 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR7P32248 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR7P32248 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR7P32248 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR7P32248 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR7P32248 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR7P32248 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR7P32248 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR7P32248 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR7P32248 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR7P32248 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR7P32248 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms