Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PVALBP20472 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PVALBP20472 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PVALBP20472 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PVALBP20472 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PVALBP20472 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PVALBP20472 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PVALBP20472 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PVALBP20472 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PVALBP20472 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PVALBP20472 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PVALBP20472 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PVALBP20472 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PVALBP20472 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PVALBP20472 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PVALBP20472 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PVALBP20472 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PVALBP20472 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PVALBP20472 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PVALBP20472 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PVALBP20472 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PVALBP20472 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PVALBP20472 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PVALBP20472 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PVALBP20472 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PVALBP20472 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PVALBP20472 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PVALBP20472 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PVALBP20472 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PVALBP20472 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PVALBP20472 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PVALBP20472 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PVALBP20472 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PVALBP20472 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PVALBP20472 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PVALBP20472 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PVALBP20472 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PVALBP20472 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PVALBP20472 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PVALBP20472 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PVALBP20472 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PVALBP20472 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PVALBP20472 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PVALBP20472 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PVALBP20472 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PVALBP20472 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PVALBP20472 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PVALBP20472 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PVALBP20472 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PVALBP20472 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PVALBP20472 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PVALBP20472 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PVALBP20472 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PVALBP20472 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PVALBP20472 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PVALBP20472 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PVALBP20472 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PVALBP20472 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PVALBP20472 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PVALBP20472 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PVALBP20472 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PVALBP20472 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PVALBP20472 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PVALBP20472 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PVALBP20472 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PVALBP20472 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PVALBP20472 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PVALBP20472 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PVALBP20472 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PVALBP20472 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PVALBP20472 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PVALBP20472 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PVALBP20472 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PVALBP20472 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PVALBP20472 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PVALBP20472 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PVALBP20472 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PVALBP20472 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PVALBP20472 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PVALBP20472 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PVALBP20472 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PVALBP20472 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PVALBP20472 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PVALBP20472 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PVALBP20472 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PVALBP20472 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PVALBP20472 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PVALBP20472 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PVALBP20472 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PVALBP20472 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PVALBP20472 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PVALBP20472 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PVALBP20472 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PVALBP20472 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PVALBP20472 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PVALBP20472 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PVALBP20472 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PVALBP20472 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PVALBP20472 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PVALBP20472 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms