Protein–RNA interactions for Protein: P0DMV2

CT45A9, Cancer/testis antigen family 45 member A9, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT45A9P0DMV2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CT45A9P0DMV2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CT45A9P0DMV2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CT45A9P0DMV2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CT45A9P0DMV2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CT45A9P0DMV2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CT45A9P0DMV2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CT45A9P0DMV2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CT45A9P0DMV2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CT45A9P0DMV2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms