Protein–RNA interactions for Protein: P0CL83

STAG3L1, Putative STAG3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L1P0CL83 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAG3L1P0CL83 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
STAG3L1P0CL83 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms