Protein–RNA interactions for Protein: P08247

SYP, Synaptophysin, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPP08247 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYPP08247 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYPP08247 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYPP08247 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYPP08247 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYPP08247 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYPP08247 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYPP08247 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYPP08247 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYPP08247 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYPP08247 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYPP08247 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYPP08247 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYPP08247 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYPP08247 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYPP08247 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYPP08247 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYPP08247 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYPP08247 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYPP08247 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYPP08247 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYPP08247 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYPP08247 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYPP08247 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYPP08247 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYPP08247 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYPP08247 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYPP08247 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYPP08247 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYPP08247 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYPP08247 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYPP08247 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYPP08247 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYPP08247 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYPP08247 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYPP08247 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYPP08247 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYPP08247 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYPP08247 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYPP08247 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYPP08247 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYPP08247 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYPP08247 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYPP08247 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYPP08247 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYPP08247 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYPP08247 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYPP08247 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYPP08247 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYPP08247 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYPP08247 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYPP08247 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYPP08247 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYPP08247 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYPP08247 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYPP08247 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYPP08247 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYPP08247 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYPP08247 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYPP08247 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYPP08247 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYPP08247 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYPP08247 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYPP08247 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYPP08247 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYPP08247 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYPP08247 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYPP08247 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYPP08247 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYPP08247 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYPP08247 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYPP08247 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYPP08247 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYPP08247 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYPP08247 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYPP08247 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYPP08247 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYPP08247 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYPP08247 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYPP08247 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYPP08247 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYPP08247 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYPP08247 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYPP08247 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYPP08247 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYPP08247 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYPP08247 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYPP08247 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYPP08247 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYPP08247 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYPP08247 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYPP08247 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYPP08247 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYPP08247 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYPP08247 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYPP08247 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYPP08247 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYPP08247 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYPP08247 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYPP08247 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.1 ms