Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLIM4O00461 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLIM4O00461 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLIM4O00461 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLIM4O00461 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLIM4O00461 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLIM4O00461 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLIM4O00461 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLIM4O00461 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLIM4O00461 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLIM4O00461 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GOLIM4O00461 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLIM4O00461 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GOLIM4O00461 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms