Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NOP58Q9Y2X3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NOP58Q9Y2X3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NOP58Q9Y2X3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms