Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2B5

VPS9D1, VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1Q9Y2B5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS9D1Q9Y2B5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms