Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK2

ATXN7L1, Ataxin-7-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L1Q9ULK2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7L1Q9ULK2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7L1Q9ULK2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7L1Q9ULK2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7L1Q9ULK2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7L1Q9ULK2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7L1Q9ULK2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7L1Q9ULK2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7L1Q9ULK2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7L1Q9ULK2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7L1Q9ULK2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7L1Q9ULK2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN7L1Q9ULK2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN7L1Q9ULK2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN7L1Q9ULK2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN7L1Q9ULK2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN7L1Q9ULK2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN7L1Q9ULK2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN7L1Q9ULK2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN7L1Q9ULK2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN7L1Q9ULK2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN7L1Q9ULK2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN7L1Q9ULK2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN7L1Q9ULK2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN7L1Q9ULK2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN7L1Q9ULK2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN7L1Q9ULK2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN7L1Q9ULK2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN7L1Q9ULK2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN7L1Q9ULK2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN7L1Q9ULK2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN7L1Q9ULK2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN7L1Q9ULK2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN7L1Q9ULK2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN7L1Q9ULK2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN7L1Q9ULK2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN7L1Q9ULK2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN7L1Q9ULK2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN7L1Q9ULK2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN7L1Q9ULK2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN7L1Q9ULK2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN7L1Q9ULK2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms