Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRPF3Q9ULD4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
BRPF3Q9ULD4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRPF3Q9ULD4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms