Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA4

AKAP11, A-kinase anchor protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP11Q9UKA4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AKAP11Q9UKA4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AKAP11Q9UKA4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AKAP11Q9UKA4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AKAP11Q9UKA4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AKAP11Q9UKA4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AKAP11Q9UKA4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AKAP11Q9UKA4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
AKAP11Q9UKA4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AKAP11Q9UKA4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AKAP11Q9UKA4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AKAP11Q9UKA4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
AKAP11Q9UKA4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AKAP11Q9UKA4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
AKAP11Q9UKA4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AKAP11Q9UKA4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AKAP11Q9UKA4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AKAP11Q9UKA4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
AKAP11Q9UKA4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
AKAP11Q9UKA4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AKAP11Q9UKA4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AKAP11Q9UKA4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AKAP11Q9UKA4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AKAP11Q9UKA4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
AKAP11Q9UKA4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
AKAP11Q9UKA4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AKAP11Q9UKA4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AKAP11Q9UKA4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AKAP11Q9UKA4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AKAP11Q9UKA4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AKAP11Q9UKA4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AKAP11Q9UKA4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AKAP11Q9UKA4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
AKAP11Q9UKA4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
AKAP11Q9UKA4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AKAP11Q9UKA4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AKAP11Q9UKA4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AKAP11Q9UKA4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
AKAP11Q9UKA4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AKAP11Q9UKA4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AKAP11Q9UKA4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
AKAP11Q9UKA4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AKAP11Q9UKA4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
AKAP11Q9UKA4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
AKAP11Q9UKA4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms