Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC31.21■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
USP35Q9P2H5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
USP35Q9P2H5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
USP35Q9P2H5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
USP35Q9P2H5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
USP35Q9P2H5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
USP35Q9P2H5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
USP35Q9P2H5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
USP35Q9P2H5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
USP35Q9P2H5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
USP35Q9P2H5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
USP35Q9P2H5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
USP35Q9P2H5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
USP35Q9P2H5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
USP35Q9P2H5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
USP35Q9P2H5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
USP35Q9P2H5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
USP35Q9P2H5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
USP35Q9P2H5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
USP35Q9P2H5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
USP35Q9P2H5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
USP35Q9P2H5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
USP35Q9P2H5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
USP35Q9P2H5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
USP35Q9P2H5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
USP35Q9P2H5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
USP35Q9P2H5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
USP35Q9P2H5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
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