Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CDK12Q9NYV4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CDK12Q9NYV4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms