Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.461e-16■■■■■ 37.5
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RBM22Q9NW64 SRSF5-202ENST00000553369 613 ntTSL 210.05□□□□□ -0.81e-16■■■■■ 37.5
RBM22Q9NW64 SRSF5-217ENST00000557154 1500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.851e-16■■■■■ 37.5
RBM22Q9NW64 SRSF5-219ENST00000557460 939 ntTSL 58.91□□□□□ -0.981e-16■■■■■ 37.5
RBM22Q9NW64 SRSF5-206ENST00000554021 567 ntTSL 4 BASIC8.33□□□□□ -1.081e-16■■■■■ 37.5
RBM22Q9NW64 SRSF5-211ENST00000555547 2057 ntTSL 58.17□□□□□ -1.11e-16■■■■■ 37.5
RBM22Q9NW64 SRSF5-207ENST00000554465 3044 ntTSL 1 (best)8.03□□□□□ -1.121e-16■■■■■ 37.5
RBM22Q9NW64 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.31e-16■■■■■ 37.5
RBM22Q9NW64 U2SURP-209ENST00000480029 2855 ntTSL 21.88□□□□□ -2.119e-7■■■■■ 37.5
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RBM22Q9NW64 IPO8-206ENST00000540979 792 ntTSL 525.18■■□□□ 1.624e-7■■■■■ 37.4
RBM22Q9NW64 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.024e-7■■■■■ 37.4
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RBM22Q9NW64 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.346e-14■■■■■ 37.3
RBM22Q9NW64 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.346e-14■■■■■ 37.3
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RBM22Q9NW64 HSPA5-201ENST00000324460 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.757e-8■■■■■ 37.1
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RBM22Q9NW64 MEMO1-205ENST00000413686 769 ntTSL 315.91■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 37
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RBM22Q9NW64 MEMO1-209ENST00000490459 1242 ntTSL 214.13□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 37
RBM22Q9NW64 MEMO1-201ENST00000295065 4505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 37
RBM22Q9NW64 MEMO1-207ENST00000426310 1336 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 37
RBM22Q9NW64 MEMO1-203ENST00000404530 1482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.073e-6■■■■■ 37
RBM22Q9NW64 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.473e-6■■■■■ 37
RBM22Q9NW64 DPY30-206ENST00000446765 1519 ntTSL 52.74□□□□□ -1.973e-6■■■■■ 37
RBM22Q9NW64 MEMO1-206ENST00000422936 327 ntTSL 51.56□□□□□ -2.163e-6■■■■■ 37
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RBM22Q9NW64 ZNF280A-201ENST00000302097 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.891e-8■■■■■ 37
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RBM22Q9NW64 KLC1-204ENST00000348520 15091 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.021e-12■■■■■ 37
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RBM22Q9NW64 CAP1-210ENST00000420216 668 ntTSL 514.53□□□□□ -0.081e-8■■■■■ 37
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RBM22Q9NW64 CAP1-214ENST00000435719 817 ntTSL 313.21□□□□□ -0.291e-8■■■■■ 37
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RBM22Q9NW64 CAP1-207ENST00000414281 772 ntTSL 411.23□□□□□ -0.611e-8■■■■■ 37
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RBM22Q9NW64 SORL1-201ENST00000260197 10904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 37
RBM22Q9NW64 SORL1-204ENST00000525532 3836 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 37
RBM22Q9NW64 EIF4A2-223ENST00000494445 629 ntTSL 28.8□□□□□ -13e-7■■■■■ 37
RBM22Q9NW64 EIF4A2-225ENST00000496382 460 ntTSL 1 (best)6.4□□□□□ -1.383e-7■■■■■ 37
RBM22Q9NW64 EIF4A2-226ENST00000497177 849 ntTSL 54.53□□□□□ -1.683e-7■■■■■ 37
RBM22Q9NW64 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.283e-7■■■■■ 36.9
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