RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600676.5

FCHO1-234, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-234ENST00000600676 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.11■■■□□ 2.09
FCHO1-234ENST00000600676 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.35■■□□□ 1.49
FCHO1-234ENST00000600676 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
FCHO1-234ENST00000600676 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.26■■□□□ 1.31
FCHO1-234ENST00000600676 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.18■■□□□ 1.3
FCHO1-234ENST00000600676 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.18■■□□□ 1.3
FCHO1-234ENST00000600676 ABCC9O60706 1549 aa22.81■■□□□ 1.24
FCHO1-234ENST00000600676 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.77■■□□□ 1.23
FCHO1-234ENST00000600676 NACADO15069 1562 aa22.58■■□□□ 1.21
FCHO1-234ENST00000600676 SCRIBQ14160 1630 aa22.53■■□□□ 1.2
FCHO1-234ENST00000600676 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
FCHO1-234ENST00000600676 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.33■■□□□ 1.17
FCHO1-234ENST00000600676 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.01■■□□□ 1.11
FCHO1-234ENST00000600676 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
FCHO1-234ENST00000600676 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.87■■□□□ 1.09
FCHO1-234ENST00000600676 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.77■■□□□ 1.08
FCHO1-234ENST00000600676 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.71■■□□□ 1.07
FCHO1-234ENST00000600676 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
FCHO1-234ENST00000600676 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.66■■□□□ 1.06
FCHO1-234ENST00000600676 WIZO95785 1651 aa21.65■■□□□ 1.06
FCHO1-234ENST00000600676 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-234ENST00000600676 SMARCA4P51532 1647 aa21.57■■□□□ 1.04
FCHO1-234ENST00000600676 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
FCHO1-234ENST00000600676 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.24■□□□□ 0.99
FCHO1-234ENST00000600676 SMARCA2P51531 1590 aa21.2■□□□□ 0.98
FCHO1-234ENST00000600676 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
FCHO1-234ENST00000600676 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.16■□□□□ 0.98
FCHO1-234ENST00000600676 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.11■□□□□ 0.97
FCHO1-234ENST00000600676 TRIM41Q8WV44 630 aa21.09■□□□□ 0.97
FCHO1-234ENST00000600676 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
FCHO1-234ENST00000600676 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.91■□□□□ 0.94
FCHO1-234ENST00000600676 ABCC8Q09428 1581 aa20.88■□□□□ 0.93
FCHO1-234ENST00000600676 HMGXB3Q12766 1538 aa20.85■□□□□ 0.93
FCHO1-234ENST00000600676 NCAPD3P42695 1498 aa20.84■□□□□ 0.93
FCHO1-234ENST00000600676 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
FCHO1-234ENST00000600676 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.65■□□□□ 0.9
FCHO1-234ENST00000600676 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
FCHO1-234ENST00000600676 SYNJ1O43426 1573 aa20.59■□□□□ 0.89
FCHO1-234ENST00000600676 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.54■□□□□ 0.88
FCHO1-234ENST00000600676 SOGA1O94964 1423 aa20.53■□□□□ 0.88
FCHO1-234ENST00000600676 CFTRP13569 1480 aa20.49■□□□□ 0.87
FCHO1-234ENST00000600676 PRDM2Q13029 1718 aa20.45■□□□□ 0.86
FCHO1-234ENST00000600676 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.45■□□□□ 0.86
FCHO1-234ENST00000600676 EEA1Q15075 1411 aa20.45■□□□□ 0.86
FCHO1-234ENST00000600676 TOP2BQ02880 1626 aa20.44■□□□□ 0.86
FCHO1-234ENST00000600676 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.42■□□□□ 0.86
FCHO1-234ENST00000600676 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.35■□□□□ 0.85
FCHO1-234ENST00000600676 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.34■□□□□ 0.85
FCHO1-234ENST00000600676 CUX1P39880 1505 aa20.33■□□□□ 0.85
FCHO1-234ENST00000600676 PCGF6Q9BYE7 350 aa20.28■□□□□ 0.84
FCHO1-234ENST00000600676 GOLGA3Q08378 1498 aa20.24■□□□□ 0.83
FCHO1-234ENST00000600676 KIF21BO75037 1637 aa20.23■□□□□ 0.83
FCHO1-234ENST00000600676 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.21■□□□□ 0.83
FCHO1-234ENST00000600676 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.2■□□□□ 0.82
FCHO1-234ENST00000600676 CEP162Q5TB80 1403 aa20.17■□□□□ 0.82
FCHO1-234ENST00000600676 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
FCHO1-234ENST00000600676 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.15■□□□□ 0.82
FCHO1-234ENST00000600676 NESP48681 1621 aa20.15■□□□□ 0.82
FCHO1-234ENST00000600676 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
FCHO1-234ENST00000600676 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.1■□□□□ 0.81
FCHO1-234ENST00000600676 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.09■□□□□ 0.81
FCHO1-234ENST00000600676 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.08■□□□□ 0.8
FCHO1-234ENST00000600676 KIF27Q86VH2 1401 aa20.07■□□□□ 0.8
FCHO1-234ENST00000600676 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.05■□□□□ 0.8
FCHO1-234ENST00000600676 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.02■□□□□ 0.8
FCHO1-234ENST00000600676 PRXQ9BXM0 1461 aa20.02■□□□□ 0.8
FCHO1-234ENST00000600676 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.02■□□□□ 0.79
FCHO1-234ENST00000600676 CUX2O14529 1486 aa19.98■□□□□ 0.79
FCHO1-234ENST00000600676 TOPBP1Q92547 1522 aa19.97■□□□□ 0.79
FCHO1-234ENST00000600676 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
FCHO1-234ENST00000600676 CLIP1P30622 1438 aa19.93■□□□□ 0.78
FCHO1-234ENST00000600676 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa19.92■□□□□ 0.78
FCHO1-234ENST00000600676 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.92■□□□□ 0.78
FCHO1-234ENST00000600676 HRCP23327 699 aa19.91■□□□□ 0.78
FCHO1-234ENST00000600676 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
FCHO1-234ENST00000600676 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
FCHO1-234ENST00000600676 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.87■□□□□ 0.77
FCHO1-234ENST00000600676 IGF1RP08069 1367 aa19.86■□□□□ 0.77
FCHO1-234ENST00000600676 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.85■□□□□ 0.77
FCHO1-234ENST00000600676 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
FCHO1-234ENST00000600676 WDR97A6NE52 1622 aa19.81■□□□□ 0.76
FCHO1-234ENST00000600676 VPS8Q8N3P4 1428 aa19.8■□□□□ 0.76
FCHO1-234ENST00000600676 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.77■□□□□ 0.76
FCHO1-234ENST00000600676 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
FCHO1-234ENST00000600676 ARAP1Q96P48 1450 aa19.72■□□□□ 0.75
FCHO1-234ENST00000600676 CUL7Q14999 1698 aa19.7■□□□□ 0.74
FCHO1-234ENST00000600676 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.7■□□□□ 0.74
FCHO1-234ENST00000600676 MRC2Q9UBG0 1479 aa19.67■□□□□ 0.74
FCHO1-234ENST00000600676 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
FCHO1-234ENST00000600676 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa19.65■□□□□ 0.74
FCHO1-234ENST00000600676 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
FCHO1-234ENST00000600676 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.62■□□□□ 0.73
FCHO1-234ENST00000600676 APLP2Q06481 763 aa19.59■□□□□ 0.73
FCHO1-234ENST00000600676 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa19.57■□□□□ 0.72
FCHO1-234ENST00000600676 WDR62O43379 1518 aa19.56■□□□□ 0.72
FCHO1-234ENST00000600676 PBRM1Q86U86 1689 aa19.54■□□□□ 0.72
FCHO1-234ENST00000600676 ERCC6Q03468 1493 aa19.5■□□□□ 0.71
FCHO1-234ENST00000600676 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.47■□□□□ 0.718e-7■■■■■ 28.6
FCHO1-234ENST00000600676 IFT140Q96RY7 1462 aa19.46■□□□□ 0.71
FCHO1-234ENST00000600676 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.6 ms