RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596536.5

FCHO1-216, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-216ENST00000596536 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.96■■□□□ 1.11
FCHO1-216ENST00000596536 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa19.06■□□□□ 0.64
FCHO1-216ENST00000596536 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.87■□□□□ 0.61
FCHO1-216ENST00000596536 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.83■□□□□ 0.61
FCHO1-216ENST00000596536 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
FCHO1-216ENST00000596536 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
FCHO1-216ENST00000596536 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.19■□□□□ 0.5
FCHO1-216ENST00000596536 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-216ENST00000596536 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.87■□□□□ 0.45
FCHO1-216ENST00000596536 ABCC9O60706 1549 aa17.74■□□□□ 0.43
FCHO1-216ENST00000596536 NACADO15069 1562 aa17.66■□□□□ 0.42
FCHO1-216ENST00000596536 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
FCHO1-216ENST00000596536 PCGF6Q9BYE7 350 aa17.62■□□□□ 0.41
FCHO1-216ENST00000596536 HRCP23327 699 aa17.59■□□□□ 0.41
FCHO1-216ENST00000596536 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa17.55■□□□□ 0.4
FCHO1-216ENST00000596536 SCRIBQ14160 1630 aa17.52■□□□□ 0.39
FCHO1-216ENST00000596536 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
FCHO1-216ENST00000596536 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.44■□□□□ 0.38
FCHO1-216ENST00000596536 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.28■□□□□ 0.36
FCHO1-216ENST00000596536 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
FCHO1-216ENST00000596536 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP17.2■□□□□ 0.34
FCHO1-216ENST00000596536 UNC13AQ9UPW8 1703 aa17.16■□□□□ 0.34
FCHO1-216ENST00000596536 TRIM41Q8WV44 630 aa17.13■□□□□ 0.33
FCHO1-216ENST00000596536 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
FCHO1-216ENST00000596536 MYT1Q01538 1121 aa17.09■□□□□ 0.33
FCHO1-216ENST00000596536 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
FCHO1-216ENST00000596536 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.03■□□□□ 0.32
FCHO1-216ENST00000596536 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.97■□□□□ 0.31
FCHO1-216ENST00000596536 BICRAQ9NZM4 1560 aa16.94■□□□□ 0.3
FCHO1-216ENST00000596536 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
FCHO1-216ENST00000596536 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
FCHO1-216ENST00000596536 WIZO95785 1651 aa16.86■□□□□ 0.29
FCHO1-216ENST00000596536 SMARCA4P51532 1647 aa16.84■□□□□ 0.29
FCHO1-216ENST00000596536 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
FCHO1-216ENST00000596536 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
FCHO1-216ENST00000596536 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.65■□□□□ 0.26
FCHO1-216ENST00000596536 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
FCHO1-216ENST00000596536 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-216ENST00000596536 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
FCHO1-216ENST00000596536 SMARCA2P51531 1590 aa16.55■□□□□ 0.24
FCHO1-216ENST00000596536 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.5■□□□□ 0.23
FCHO1-216ENST00000596536 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.47■□□□□ 0.23
FCHO1-216ENST00000596536 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
FCHO1-216ENST00000596536 ABCC8Q09428 1581 aa16.45■□□□□ 0.22
FCHO1-216ENST00000596536 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
FCHO1-216ENST00000596536 UBTFP17480 764 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
FCHO1-216ENST00000596536 SOGA1O94964 1423 aa16.35■□□□□ 0.21
FCHO1-216ENST00000596536 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
FCHO1-216ENST00000596536 HMGXB3Q12766 1538 aa16.32■□□□□ 0.2
FCHO1-216ENST00000596536 NCAPD3P42695 1498 aa16.29■□□□□ 0.2
FCHO1-216ENST00000596536 NEUROD1Q13562 356 aa16.29■□□□□ 0.2
FCHO1-216ENST00000596536 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-216ENST00000596536 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-216ENST00000596536 CEP162Q5TB80 1403 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-216ENST00000596536 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-216ENST00000596536 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-216ENST00000596536 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
FCHO1-216ENST00000596536 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
FCHO1-216ENST00000596536 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.13■□□□□ 0.17
FCHO1-216ENST00000596536 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-216ENST00000596536 DNAJC5BQ9UF47 199 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-216ENST00000596536 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-216ENST00000596536 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-216ENST00000596536 SYNJ1O43426 1573 aa16.05■□□□□ 0.16
FCHO1-216ENST00000596536 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
FCHO1-216ENST00000596536 EEA1Q15075 1411 aa16.03■□□□□ 0.16
FCHO1-216ENST00000596536 GOLGA3Q08378 1498 aa16.02■□□□□ 0.15
FCHO1-216ENST00000596536 CFTRP13569 1480 aa16.01■□□□□ 0.15
FCHO1-216ENST00000596536 PRDM2Q13029 1718 aa16■□□□□ 0.15
FCHO1-216ENST00000596536 BCL11AQ9H165 835 aa15.99■□□□□ 0.15
FCHO1-216ENST00000596536 TOP2BQ02880 1626 aa15.98■□□□□ 0.15
FCHO1-216ENST00000596536 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.98■□□□□ 0.15
FCHO1-216ENST00000596536 APLP2Q06481 763 aa15.96■□□□□ 0.15
FCHO1-216ENST00000596536 CLIP1P30622 1438 aa15.94■□□□□ 0.14
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
FCHO1-216ENST00000596536 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.89■□□□□ 0.13
FCHO1-216ENST00000596536 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.89■□□□□ 0.13
FCHO1-216ENST00000596536 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.87■□□□□ 0.13
FCHO1-216ENST00000596536 CUX1P39880 1505 aa15.85■□□□□ 0.13
FCHO1-216ENST00000596536 KIF21BO75037 1637 aa15.83■□□□□ 0.12
FCHO1-216ENST00000596536 MIER1Q8N108 512 aa15.82■□□□□ 0.12
FCHO1-216ENST00000596536 VPS8Q8N3P4 1428 aa15.8■□□□□ 0.12
FCHO1-216ENST00000596536 ITGAEP38570 1179 aa15.76■□□□□ 0.11
FCHO1-216ENST00000596536 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
FCHO1-216ENST00000596536 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.71■□□□□ 0.11
FCHO1-216ENST00000596536 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.7■□□□□ 0.1
FCHO1-216ENST00000596536 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
FCHO1-216ENST00000596536 ANP32EQ9BTT0 268 aa15.67■□□□□ 0.1
FCHO1-216ENST00000596536 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.67■□□□□ 0.1
FCHO1-216ENST00000596536 KIF27Q86VH2 1401 aa15.65■□□□□ 0.1
FCHO1-216ENST00000596536 PRXQ9BXM0 1461 aa15.65■□□□□ 0.1
FCHO1-216ENST00000596536 NESP48681 1621 aa15.65■□□□□ 0.1
FCHO1-216ENST00000596536 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.63■□□□□ 0.09
FCHO1-216ENST00000596536 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.62■□□□□ 0.09
FCHO1-216ENST00000596536 ARAP1Q96P48 1450 aa15.59■□□□□ 0.09
FCHO1-216ENST00000596536 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
FCHO1-216ENST00000596536 TOPBP1Q92547 1522 aa15.57■□□□□ 0.08
FCHO1-216ENST00000596536 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
FCHO1-216ENST00000596536 P3H3Q8IVL6 736 aa15.56■□□□□ 0.08
FCHO1-216ENST00000596536 CUX2O14529 1486 aa15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms