RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491520.5

CDC45-211, Transcript of cell division cycle 45, humanhuman

TSL 5

Gene CDC45, Length 723 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45-211ENST00000491520 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.3■■■■■ 5.16
CDC45-211ENST00000491520 ABCC9O60706 1549 aa42.86■■■■■ 4.45
CDC45-211ENST00000491520 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.6■■■■■ 4.41
CDC45-211ENST00000491520 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.71■■■■■ 4.11
CDC45-211ENST00000491520 NACADO15069 1562 aa40.34■■■■■ 4.05
CDC45-211ENST00000491520 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.3■■■■■ 4.04
CDC45-211ENST00000491520 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.09■■■■■ 4.01
CDC45-211ENST00000491520 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.82■■■■□ 3.97
CDC45-211ENST00000491520 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.71■■■■□ 3.95
CDC45-211ENST00000491520 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.67■■■■□ 3.94
CDC45-211ENST00000491520 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.43■■■■□ 3.9
CDC45-211ENST00000491520 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.16■■■■□ 3.86
CDC45-211ENST00000491520 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.06■■■■□ 3.84
CDC45-211ENST00000491520 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.98■■■■□ 3.83
CDC45-211ENST00000491520 SCRIBQ14160 1630 aa38.81■■■■□ 3.8
CDC45-211ENST00000491520 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.68■■■■□ 3.78
CDC45-211ENST00000491520 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.65■■■■□ 3.78
CDC45-211ENST00000491520 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.55■■■■□ 3.76
CDC45-211ENST00000491520 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.27■■■■□ 3.56
CDC45-211ENST00000491520 NCAPD3P42695 1498 aa37.2■■■■□ 3.55
CDC45-211ENST00000491520 ERCC6Q03468 1493 aa37.1■■■■□ 3.53
CDC45-211ENST00000491520 CUX2O14529 1486 aa37.08■■■■□ 3.53
CDC45-211ENST00000491520 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.06■■■■□ 3.52
CDC45-211ENST00000491520 SMARCA2P51531 1590 aa37■■■■□ 3.51
CDC45-211ENST00000491520 SMARCA4P51532 1647 aa36.98■■■■□ 3.51
CDC45-211ENST00000491520 HMGXB3Q12766 1538 aa36.95■■■■□ 3.51
CDC45-211ENST00000491520 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
CDC45-211ENST00000491520 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
CDC45-211ENST00000491520 NESP48681 1621 aa36.7■■■■□ 3.47
CDC45-211ENST00000491520 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.6■■■■□ 3.45
CDC45-211ENST00000491520 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.46■■■■□ 3.43
CDC45-211ENST00000491520 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.42■■■■□ 3.42
CDC45-211ENST00000491520 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
CDC45-211ENST00000491520 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.27■■■■□ 3.4
CDC45-211ENST00000491520 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.25■■■■□ 3.39
CDC45-211ENST00000491520 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.08■■■■□ 3.37
CDC45-211ENST00000491520 WIZO95785 1651 aa35.98■■■■□ 3.35
CDC45-211ENST00000491520 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.97■■■■□ 3.35
CDC45-211ENST00000491520 WDR62O43379 1518 aa35.87■■■■□ 3.33
CDC45-211ENST00000491520 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.79■■■■□ 3.32
CDC45-211ENST00000491520 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.7■■■■□ 3.31
CDC45-211ENST00000491520 TRIM41Q8WV44 630 aa35.62■■■■□ 3.29
CDC45-211ENST00000491520 CFTRP13569 1480 aa35.6■■■■□ 3.29
CDC45-211ENST00000491520 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
CDC45-211ENST00000491520 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
CDC45-211ENST00000491520 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
CDC45-211ENST00000491520 OSCARQ8IYS5 282 aa35.31■■■■□ 3.24
CDC45-211ENST00000491520 PRDM2Q13029 1718 aa35.26■■■■□ 3.24
CDC45-211ENST00000491520 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.1■■■■□ 3.21
CDC45-211ENST00000491520 IFT140Q96RY7 1462 aa35.07■■■■□ 3.2
CDC45-211ENST00000491520 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
CDC45-211ENST00000491520 TOPBP1Q92547 1522 aa34.97■■■■□ 3.19
CDC45-211ENST00000491520 ABCC8Q09428 1581 aa34.92■■■■□ 3.18
CDC45-211ENST00000491520 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.88■■■■□ 3.17
CDC45-211ENST00000491520 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.88■■■■□ 3.17
CDC45-211ENST00000491520 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.88■■■■□ 3.17
CDC45-211ENST00000491520 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.85■■■■□ 3.17
CDC45-211ENST00000491520 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
CDC45-211ENST00000491520 ARHGEF11O15085 1522 aa34.76■■■■□ 3.15
CDC45-211ENST00000491520 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
CDC45-211ENST00000491520 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.65■■■■□ 3.144e-19■■■■■ 27.4
CDC45-211ENST00000491520 CHD1O14646 1710 aa34.61■■■■□ 3.13
CDC45-211ENST00000491520 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.6■■■■□ 3.13
CDC45-211ENST00000491520 FBLN2P98095 1184 aa34.54■■■■□ 3.12
CDC45-211ENST00000491520 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.5■■■■□ 3.11
CDC45-211ENST00000491520 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.46■■■■□ 3.11
CDC45-211ENST00000491520 SOGA1O94964 1423 aa34.44■■■■□ 3.1
CDC45-211ENST00000491520 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
CDC45-211ENST00000491520 ARAP1Q96P48 1450 aa34.38■■■■□ 3.09
CDC45-211ENST00000491520 WDR97A6NE52 1622 aa34.36■■■■□ 3.09
CDC45-211ENST00000491520 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.35■■■■□ 3.09
CDC45-211ENST00000491520 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.33■■■■□ 3.09
CDC45-211ENST00000491520 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
CDC45-211ENST00000491520 CUX1P39880 1505 aa34.25■■■■□ 3.07
CDC45-211ENST00000491520 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
CDC45-211ENST00000491520 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
CDC45-211ENST00000491520 SYNJ1O43426 1573 aa34.21■■■■□ 3.07
CDC45-211ENST00000491520 GRIN2BQ13224 1484 aa34.2■■■■□ 3.06
CDC45-211ENST00000491520 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.19■■■■□ 3.06
CDC45-211ENST00000491520 SYNJ2O15056 1496 aa34.11■■■■□ 3.05
CDC45-211ENST00000491520 PBRM1Q86U86 1689 aa34.04■■■■□ 3.04
CDC45-211ENST00000491520 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.03■■■■□ 3.04
CDC45-211ENST00000491520 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.94■■■■□ 3.02
CDC45-211ENST00000491520 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.92■■■■□ 3.02
CDC45-211ENST00000491520 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
CDC45-211ENST00000491520 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.79■■■■□ 3
CDC45-211ENST00000491520 GRIN2AQ12879 1464 aa33.75■■■□□ 2.99
CDC45-211ENST00000491520 ADAMTS12P58397 1594 aa33.71■■■□□ 2.99
CDC45-211ENST00000491520 TOP2BQ02880 1626 aa33.65■■■□□ 2.98
CDC45-211ENST00000491520 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.65■■■□□ 2.98
CDC45-211ENST00000491520 NUP160Q12769 1436 aa33.62■■■□□ 2.97
CDC45-211ENST00000491520 CEP170Q5SW79 1584 aa33.62■■■□□ 2.97
CDC45-211ENST00000491520 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.6■■■□□ 2.97
CDC45-211ENST00000491520 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.6■■■□□ 2.97
CDC45-211ENST00000491520 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.53■■■□□ 2.96
CDC45-211ENST00000491520 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.5■■■□□ 2.95
CDC45-211ENST00000491520 SHROOM2Q13796 1616 aa33.5■■■□□ 2.95
CDC45-211ENST00000491520 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.35■■■□□ 2.93
CDC45-211ENST00000491520 JPH4Q96JJ6 628 aa33.26■■■□□ 2.91
CDC45-211ENST00000491520 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.23■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms