Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAPOLBQ9NRJ5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms