Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAR1AQ9NR31 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAR1AQ9NR31 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAR1AQ9NR31 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAR1AQ9NR31 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms