Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM8AQ9HCN3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM8AQ9HCN3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms