Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GFRA4Q9GZZ7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms