Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL25A1Q9BXS0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL25A1Q9BXS0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.6 ms