Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV20

MRI1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRI1Q9BV20 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
MRI1Q9BV20 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms