Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EFHD1Q9BUP0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EFHD1Q9BUP0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms