Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAAF1Q9BRP4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms