Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
COG3Q96JB2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
COG3Q96JB2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
COG3Q96JB2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms