Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC34Q96HJ3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC34Q96HJ3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms