Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00612Q8N6U2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00612Q8N6U2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00612Q8N6U2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms