Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1W1

ARHGEF28, Rho guanine nucleotide exchange factor 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF28Q8N1W1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ARHGEF28Q8N1W1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARHGEF28Q8N1W1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
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