Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1D0

SLC22A18AS, Beckwith-Wiedemann syndrome chromosomal region 1 candidate gene B protein, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A18ASQ8N1D0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A18ASQ8N1D0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A18ASQ8N1D0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A18ASQ8N1D0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A18ASQ8N1D0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A18ASQ8N1D0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A18ASQ8N1D0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A18ASQ8N1D0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A18ASQ8N1D0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A18ASQ8N1D0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A18ASQ8N1D0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A18ASQ8N1D0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A18ASQ8N1D0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A18ASQ8N1D0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A18ASQ8N1D0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A18ASQ8N1D0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A18ASQ8N1D0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A18ASQ8N1D0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A18ASQ8N1D0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A18ASQ8N1D0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A18ASQ8N1D0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A18ASQ8N1D0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A18ASQ8N1D0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC22A18ASQ8N1D0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A18ASQ8N1D0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms