Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC158Q5M9N0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC158Q5M9N0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC158Q5M9N0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms