Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC93Q567U6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC93Q567U6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC93Q567U6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC93Q567U6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC93Q567U6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC93Q567U6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC93Q567U6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC93Q567U6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC93Q567U6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC93Q567U6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC93Q567U6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms