Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZIC1Q15915 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIC1Q15915 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms