Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
NKX1-1Q15270 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NKX1-1Q15270 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
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