Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPNMBQ14956 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPNMBQ14956 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPNMBQ14956 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
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