Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HNF4GQ14541 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms