Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPRIN1Q14444 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPRIN1Q14444 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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