Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH18Q13634 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH18Q13634 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH18Q13634 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH18Q13634 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH18Q13634 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH18Q13634 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH18Q13634 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH18Q13634 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH18Q13634 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH18Q13634 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH18Q13634 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH18Q13634 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH18Q13634 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH18Q13634 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH18Q13634 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH18Q13634 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH18Q13634 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH18Q13634 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH18Q13634 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDH18Q13634 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH18Q13634 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH18Q13634 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
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