Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
SLFN5Q08AF3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SLFN5Q08AF3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms