Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX4Q06945 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms