Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAX2Q02962 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms