Protein–RNA interactions for Protein: P82673

MRPS35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P82673 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms