Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERVK_113P62684 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HERVK_113P62684 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERVK_113P62684 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms