Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP54P61011 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP54P61011 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP54P61011 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP54P61011 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP54P61011 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP54P61011 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP54P61011 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP54P61011 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP54P61011 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP54P61011 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP54P61011 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRP54P61011 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP54P61011 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP54P61011 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP54P61011 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP54P61011 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP54P61011 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP54P61011 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP54P61011 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP54P61011 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP54P61011 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP54P61011 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP54P61011 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRP54P61011 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP54P61011 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP54P61011 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP54P61011 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP54P61011 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP54P61011 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRP54P61011 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP54P61011 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP54P61011 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP54P61011 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP54P61011 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP54P61011 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP54P61011 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRP54P61011 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP54P61011 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP54P61011 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP54P61011 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP54P61011 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP54P61011 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP54P61011 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRP54P61011 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP54P61011 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP54P61011 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP54P61011 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP54P61011 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP54P61011 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP54P61011 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP54P61011 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP54P61011 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP54P61011 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SRP54P61011 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP54P61011 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP54P61011 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP54P61011 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP54P61011 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP54P61011 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP54P61011 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRP54P61011 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP54P61011 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP54P61011 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP54P61011 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP54P61011 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP54P61011 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP54P61011 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP54P61011 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP54P61011 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP54P61011 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRP54P61011 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRP54P61011 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRP54P61011 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRP54P61011 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRP54P61011 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRP54P61011 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRP54P61011 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRP54P61011 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRP54P61011 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRP54P61011 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRP54P61011 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SRP54P61011 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRP54P61011 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRP54P61011 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRP54P61011 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRP54P61011 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRP54P61011 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRP54P61011 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRP54P61011 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRP54P61011 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRP54P61011 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRP54P61011 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRP54P61011 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRP54P61011 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRP54P61011 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRP54P61011 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRP54P61011 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRP54P61011 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRP54P61011 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms