Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCPP55072 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCPP55072 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCPP55072 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCPP55072 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCPP55072 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCPP55072 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCPP55072 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCPP55072 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VCPP55072 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCPP55072 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCPP55072 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCPP55072 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCPP55072 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCPP55072 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCPP55072 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCPP55072 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCPP55072 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
VCPP55072 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCPP55072 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCPP55072 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCPP55072 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCPP55072 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VCPP55072 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCPP55072 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCPP55072 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCPP55072 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VCPP55072 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCPP55072 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCPP55072 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCPP55072 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCPP55072 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCPP55072 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCPP55072 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VCPP55072 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCPP55072 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCPP55072 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCPP55072 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VCPP55072 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VCPP55072 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VCPP55072 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VCPP55072 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VCPP55072 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VCPP55072 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VCPP55072 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VCPP55072 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VCPP55072 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
VCPP55072 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
VCPP55072 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
VCPP55072 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
VCPP55072 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
VCPP55072 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VCPP55072 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VCPP55072 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VCPP55072 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VCPP55072 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VCPP55072 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCPP55072 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VCPP55072 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCPP55072 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCPP55072 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCPP55072 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCPP55072 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCPP55072 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VCPP55072 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VCPP55072 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCPP55072 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCPP55072 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCPP55072 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCPP55072 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCPP55072 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCPP55072 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCPP55072 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCPP55072 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCPP55072 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
VCPP55072 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCPP55072 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCPP55072 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCPP55072 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCPP55072 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCPP55072 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCPP55072 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCPP55072 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCPP55072 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCPP55072 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCPP55072 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCPP55072 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCPP55072 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCPP55072 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VCPP55072 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCPP55072 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCPP55072 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCPP55072 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCPP55072 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCPP55072 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCPP55072 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCPP55072 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCPP55072 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VCPP55072 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCPP55072 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms