Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP3M2P53677 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP3M2P53677 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms