Protein–RNA interactions for Protein: P46108

CRK, Adapter molecule crk, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRKP46108 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRKP46108 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRKP46108 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRKP46108 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRKP46108 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRKP46108 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRKP46108 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRKP46108 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRKP46108 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CRKP46108 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CRKP46108 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRKP46108 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRKP46108 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRKP46108 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRKP46108 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRKP46108 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRKP46108 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRKP46108 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRKP46108 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRKP46108 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRKP46108 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRKP46108 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRKP46108 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRKP46108 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRKP46108 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRKP46108 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRKP46108 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRKP46108 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRKP46108 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRKP46108 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRKP46108 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRKP46108 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRKP46108 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRKP46108 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRKP46108 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRKP46108 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRKP46108 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRKP46108 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRKP46108 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRKP46108 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRKP46108 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRKP46108 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CRKP46108 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRKP46108 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRKP46108 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRKP46108 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRKP46108 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRKP46108 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRKP46108 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRKP46108 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRKP46108 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRKP46108 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRKP46108 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRKP46108 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRKP46108 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRKP46108 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRKP46108 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRKP46108 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRKP46108 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRKP46108 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRKP46108 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CRKP46108 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CRKP46108 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CRKP46108 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRKP46108 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRKP46108 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRKP46108 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRKP46108 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CRKP46108 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRKP46108 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRKP46108 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRKP46108 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRKP46108 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRKP46108 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRKP46108 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRKP46108 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRKP46108 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRKP46108 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRKP46108 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRKP46108 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRKP46108 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRKP46108 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRKP46108 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRKP46108 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRKP46108 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRKP46108 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRKP46108 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRKP46108 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRKP46108 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRKP46108 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRKP46108 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRKP46108 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRKP46108 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRKP46108 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CRKP46108 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRKP46108 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRKP46108 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRKP46108 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRKP46108 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRKP46108 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms