Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP13P45452 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP13P45452 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP13P45452 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MMP13P45452 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP13P45452 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MMP13P45452 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP13P45452 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP13P45452 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP13P45452 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP13P45452 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP13P45452 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP13P45452 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP13P45452 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP13P45452 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP13P45452 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP13P45452 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP13P45452 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP13P45452 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP13P45452 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP13P45452 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP13P45452 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP13P45452 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP13P45452 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP13P45452 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP13P45452 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP13P45452 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP13P45452 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP13P45452 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP13P45452 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP13P45452 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP13P45452 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP13P45452 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP13P45452 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP13P45452 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP13P45452 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP13P45452 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP13P45452 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP13P45452 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP13P45452 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP13P45452 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP13P45452 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP13P45452 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP13P45452 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP13P45452 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP13P45452 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP13P45452 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP13P45452 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP13P45452 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP13P45452 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP13P45452 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MMP13P45452 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP13P45452 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP13P45452 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP13P45452 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP13P45452 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP13P45452 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP13P45452 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP13P45452 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP13P45452 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP13P45452 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP13P45452 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP13P45452 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP13P45452 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP13P45452 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP13P45452 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP13P45452 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP13P45452 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP13P45452 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP13P45452 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP13P45452 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP13P45452 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP13P45452 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP13P45452 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP13P45452 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP13P45452 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP13P45452 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP13P45452 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP13P45452 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP13P45452 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP13P45452 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP13P45452 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP13P45452 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP13P45452 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP13P45452 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP13P45452 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP13P45452 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP13P45452 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP13P45452 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP13P45452 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP13P45452 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP13P45452 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP13P45452 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP13P45452 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP13P45452 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP13P45452 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP13P45452 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP13P45452 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP13P45452 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP13P45452 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms