Protein–RNA interactions for Protein: P41732

TSPAN7, Tetraspanin-7, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7P41732 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN7P41732 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms